Job Beschreibung

„Forschen für ein Leben ohne Krebs“ – das ist unsere Aufgabe am Deutschen Krebsforschungszentrum. Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können. Jeder Beitrag zählt – ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.

Gemeinsam mit universitären Partnern an sieben renommierten Partner­standorten haben wir das Deutsche Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKTK) gegründet.

Am DKTK Partnerstandort Freiburg haben wir ab sofort eine freie Stelle als

Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) im Bereich Bioinformatik

Kennziffer: 2025-0007

• Freiburg im Breisgau
• Vollzeit
• DKTK Partnerstandort Freiburg – Institut für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitätsklinikums Freiburg

Im Rahmen des DKTK spielen Joint Fundings eine zentrale Rolle. Diese Forschungsprojekte sind ein fester Bestandteil der wissenschaftlichen Arbeit in Freiburg und zeichnen sich durch die enge, standortübergreifende Zusammenarbeit innerhalb des DKTK aus.
Das Translationszentrum ist in den Räumlichkeiten des Instituts für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitäts­klinikums Freiburg angesiedelt.

Ihre Aufgaben:

Die ausgeschriebene Tätigkeit umfasst die Entwicklung und Anwendung bioinformatischer Methoden zur Analyse und Integration heterogener Omics-Datensätze, wie Genomik, Transkriptomik und Mikrobiom-Daten. Ziel ist es, Biomarker und Krank­heitsmerkmale zu identifizieren, die für die Diagnose, Patientenselektion und Therapieempfehlungen von Bedeutung sind. Ein Schwerpunkt liegt auf der Auswertung von Patienten- und Organoiddaten sowie der Korrelation von Mikrobiom-Daten mit Tumor­merkmalen und molekularen Subtypen (z. B. CMS, MSI).

Zur Erfüllung dieser Aufgaben werden maschinelle Lernverfahren und statistische Modelle eingesetzt, um Krankheitsstadien, Signalwegaktivitäten und Biomarker zu charakterisieren und prädiktive Modelle zu entwickeln. Weitere Tätigkeiten umfassen die Nutzung von Zelltyp­dekonvolutionstools zur Analyse der Tumormikroumgebung und die enge Zusammenarbeit mit interdisziplinären Teams, beispielsweise in molekularen Tumorboards, um translationale Ansätze in der Krebsforschung voranzutreiben.

Abgerundet wird das Aufgabenprofil durch die Validierung von Biomarkern und Modellen an unabhängigen Datensätzen sowie die Entwicklung strategischer Ansätze zur gezielten mikrobiellen Bekämpfung, die langfristig zur Prävention und Therapie von Krebserkrankungen beitragen könnten.

Ihr Profil:

• Abgeschlossenes Studium in einer Naturwissenschaft (z. B. Bioinformatik, Physik, Informatik, Mathematik)
• Erfahrung in der Bioinformatik (Auswertungen von Sequenz­ierungsdaten aller Art, insbesondere DNA-Seq, RNA-Seq, Proteomik, Mikrobiomik)
• Kenntnisse in der Analyse und Interpretation von Mikrobiom-Datensätzen
• Erfahrung im Anwenden von Methoden der künstlichen Intelligenz
• Interesse an biologischen / medizinischen Fragestellungen und Bereitschaft zu interdisziplinärer Arbeit
• Schnelle Auffassungsgabe und selbstständiges Arbeiten
• Umfassende Kenntnisse in wissenschaftlicher Programmier­sprache (z. B. R, Python)
• Ausgeprägte Kommunikationsstärke sowie Organisations- und Team­fähigkeit
• Selbstständige und zielorientierte Arbeitsweise, Zuverlässigkeit und die Bereitschaft, Neues zu lernen
• Deutsche und englische Sprach­kenntnisse

Unser Angebot:

• Hervorragende Rahmen­bedingungen: modernste State-of-Art Infrastruktur und Möglichkeit zum internationalen Austausch auf Spitzenniveau
• 30 Tage Urlaub
• Flexible Arbeitszeiten
• Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen
• Möglichkeit zur mobilen Arbeit und Teilzeitarbeit
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld
• Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket
• Entfalten Sie Ihr volles Potenzial: gezielte Angebote für Ihre persönliche Entwicklung fördern Ihre Talente
• Unser betriebliches Gesundheitsmanagement bietet ein ganzheitliches Angebot für Ihr Wohlbefinden

Ihre Ansprechperson:
Frau Miriam von Scheibner
Telefon +49 (0)761/270-84673

Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet. Eine Verlängerung ist möglich.

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Wir sind davon überzeugt: ein inno­vatives Forschungs- und Arbeits­umfeld lebt von der Vielfalt seiner Beschäf­tigten. Daher freuen wir uns über Bewer­bungen von talen­tierten Menschen, unab­hängig von Geschlecht, kulturellem Hinter­grund, Natio­nalität, ethnischer Zuge­hörigkeit, sexueller Identität, körper­lichen Fähigkeiten, Religion und Alter. Menschen mit Schwer­behin­derung werden bei gleicher Eignung bevorzugt.

Hinweis: Wir unte­rliegen den Vorschriften des Infek­tions­schutz­gesetzes (IfSG). Deshalb müssen alle unsere Beschäf­tigten einen Immu­nitäts­nach­weis gegen Masern vorlegen.

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Deutsches Krebsforschungszentrum | Im Neuenheimer Feld 280 | 69120 Heidelberg | www.dkfz.de